格雷戈尔·孟德尔分子植物生物学研究所Magnus Nordborg博士应邀访问并作学术报告

2025年10月15日，格雷戈尔·孟德尔分子植物生物学研究所（Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology，GMl）的所长Magnus Nordborg博士，在生命科学学院金光楼101报告厅进行了题为“A comparison of 27 Arabidopsis thaliana genomes and the path toward an unbiased characterization of genetic polymorphism”的报告。

基于拟南芥的全基因组的研究揭示了一个令人惊讶的事实，植物基因组的多样性，远比我们想象的更加丰富。研究团队利用PacBio长读长测序技术，对27个拟南芥个体的完整基因组进行了深入分析。结果发现，拟南芥的基因组大小差异主要来自难以组装的串联重复序列。而在这些区域之外，虽然基因组的总体长度变化不大，却存在大量结构变异，尤其是由转座子插入造成的。研究者还观察到一个显著现象：拟南芥的泛基因组坐标系统在不断扩张。当样本达到27个时，其泛基因组的体积已经比任何单一基因组都要大出约70%。这一结果说明，仅仅依赖一个参考基因组，并不能代表整个物种的遗传全貌。每一个新样本的加入，都为拟南芥的遗传版图增添新的拼图。研究还指出，常用的短读长测序方法在数据分析中存在一些潜在偏差：SNP变异检测会受到参考基因组选择的影响，转录组与甲基化组分析也可能因比对到错误参考序列而出现误差。这些发现提醒我们，过度依赖单一参考基因组，可能会掩盖真实的遗传多样性，甚至影响对基因功能的理解。

深入分析全基因组多态性数据，不仅能帮助我们理解植物基因组的演化机制，也为揭示转座子活动、结构变异与物种适应性进化提供了全新视角。这项研究展示了基因组科学的未来方向——从单一参考基因组走向动态、包容的泛基因组时代。

本次报告由王伟研究员主持。Magnus Nordborg博士的报告内容生动翔实，深化了在场师生对拟南芥基因组的理解，现场反响热烈。报告结束后，Magnus Nordborg博士与师生进行了深入交流，并耐心解答了大家提出的问题。