肖俊宇研究组发现恶性疟原虫演化出多种“劫持”IgM的分子机制
疟疾仍然是世界范围内的重要公共卫生问题。据世界卫生组织统计,2020年全球共计约有2.41亿人感染疟疾,造成约62.7万人死亡[1]。疟疾是一种由疟原虫感染引起的寄生虫病,其中恶性疟原虫致死率最高。恶性疟原虫以裂殖子形式感染红细胞并在其中繁殖,最终导致红细胞的裂解,从而引起发热和溶血性贫血等临床症状。一些被感染的红细胞会黏附在胎盘或者大脑的内皮细胞上,引起胎型疟和脑型疟等危重症状。
抗体是人体免疫系统的核心组成部分,对抵御包括恶性疟原虫在内的多种病原体具有重要保护作用。其中,IgM型抗体是人体体液免疫反应的第一道防线,主要以五聚体的形式存在,包含十个抗原结合位点,能够高效地结合并中和病原体[2-3]。此外,IgM还能有效的激活经典补体通路,在抵御疟疾的过程中发挥重要作用[4]。北京大学肖俊宇研究组聚焦对IgM分子机制的研究,在之前工作中阐明了IgM五聚体组装和黏膜转运的机制、以及IgM被特异性受体识别的机制[5, 6]。
在与人类长期的“军备竞赛”中,恶性疟原虫演化出了拮抗IgM的机制。例如,恶性疟原虫会表达一类被称为PfEMP1的毒力蛋白,并将其分泌至红细胞表面。这些蛋白分子量为 250~350 kDa,有一个很大的胞外区,包含多个达菲样结构域(Duffy-binding-like domain, DBL),可以结合很多人体分子[7]。例如,PfEMP1家族的VAR2CSA蛋白能够结合胎盘表面的硫酸软骨素,从而将感染的红细胞滞留于胎盘中的毛细血管,引起胎型疟[8]。PfEMP1-TM284VAR1则能够显著引起红细胞的花簇状聚集(Rosetting),导致脑型疟[9]。定位在恶性疟原虫裂殖子表面的DBLMSP蛋白家族成员也能够招募IgM并利用其逃逸人体的免疫攻击[10]。对这些恶性疟原虫蛋白与IgM的互作机制之前还没有得到充分理解。
2023年5月8 日,北京大学蛋白质与植物基因研究国家重点实验室肖俊宇课题组在Nature Communications期刊发表了题为“Plasmodium falciparumhas evolved multiple mechanisms to hijack human immunoglobulin M”的研究成果,发现恶性疟原虫蛋白演化出了多种不同的IgM结合模式,为进一步理解恶性疟原虫的免疫逃逸机制提供了重要基础。
图1. 四种恶性疟原虫蛋白与IgM核心区形成复合体的冷冻电镜结构。
该研究体外纯化了VAR2CSA和TM284VAR1的胞外域,以及DBLMSP和DBLMSP2的DBL结构域,并将它们分别与IgM五聚体的核心区域组装成复合体,然后利用冷冻电镜技术解析了这些复合体的结构(图1)。结果显示,虽然这些恶性疟原虫蛋白均通过其DBL结构域与IgM的中心区结合,但它们与IgM的相互作用存在多种不同模式。VAR2CSA通过DBL3X和DBL5ε两个结构域同时与三个IgM-Fc(Fcμ)单元结合。DBL3X通过子结构域1(SD1)结合Fcμ2B链和Fcμ3B链,而DBL5ε则通过SD1与Fcμ1B和Fcμ2B相互作用。另一个PfEMP1蛋白TM284VAR1虽然也含有多个DBL结构域,但只利用其DBL4ζ结构域与IgM结合。与DBL3X和DBL5ε的结合模式不同,DBL4ζ通过子结构域SD1和SD2介导与Fcμ1B、Fcμ2A和Fcμ2B的相互作用。DBLMSP家族的两个蛋白DBLMSP和DBLMSP2则通过其DBL结构域中的三个子结构域SD1、SD2和SD3与Fcμ1A、Fcμ1B和Fcμ2B链结合,展示了另外两种不同的结合模式。
那么,恶性疟原虫是如何利用IgM来逃逸人体的免疫系统呢?根据结构研究和生化结果分析,可以将其免疫逃逸机制归纳为以下三个方面:首先,恶性疟原虫蛋白与IgM的结合区域是IgM受体分子(pIgR、FcμR等)相互作用的主要热点区域,因此恶性疟原虫蛋白与IgM的结合会干扰IgM与受体的结合,从而抑制相关的免疫信号通路。其次,IgM会遮盖许多已知的抗原表位,从而使恶性疟原虫蛋白逃逸人体IgG中和抗体的攻击。此外,由于空间位阻效应,与恶性疟原虫蛋白结合的IgM无法再与C1复合体结合、或者无法与抗原发生有效结合,从而阻碍IgM对经典补体途径的激活(图2)。
图2. 恶性疟原虫利用IgM介导免疫逃逸。
总之,这一工作厘清了恶性疟原虫蛋白与IgM相互作用的复杂分子机制。本应作为人体免疫系统攻击疟原虫有效武器的IgM,反而被恶性疟原虫的多个分子以不同方式“劫持”,充当了保护疟原虫的“盾牌”(图3)。
图3. IgM被恶性疟原虫蛋白劫持充当“盾牌”。
蛋白质与植物基因研究国家重点实验室、北京大学生命科学学院、北大清华生命科学联合中心肖俊宇研究员为该论文的通讯作者。北京大学博士后纪成功和生命科学学院19级博士生沈皓为该论文的共同第一作者。本研究得到了昌平实验室、北京大学生命科学学院启东产业创新基金和北京大学博雅博士后项目的支持。
原文链接:
https://www.nature.com/articles/s41467-023-38320-z
参考文献:
1. World malaria report 2021. Geneva: World Health Organization (2021). Licence: CC BY-NC-SA 3.0 IGO.
2. Heyman, B. & Shulman, M. J. in Encyclopedia of Immunobiology (ed Michael J. H. Ratcliffe) 1-14 (Academic Press, 2016).
3. Keyt, B. A., Baliga, R., Sinclair, A. M., Carroll, S. F. & Peterson, M. S. Structure, Function, and Therapeutic Use of IgM Antibodies. Antibodies (Basel) 9, doi:10.3390/antib9040053 (2020).
4. Boyle, M. J. et al. IgM in human immunity to Plasmodium falciparum malaria. Sci Adv 5, eaax4489, doi:10.1126/sciadv.aax4489 (2019).
5. Li, Y.et al.Structural insights into immunoglobulin M.Science367, 1014-1017, doi:10.1126/science.aaz5425 (2020).
6. Li, Y.et al.Immunoglobulin M perception by FcmuR.Nature615, 907-912, doi:10.1038/s41586-023-05835-w (2023).
7. Wahlgren, M., Goel, S. & Akhouri, R. R. Variant surface antigens ofPlasmodium falciparumand their roles in severe malaria.Nat Rev Microbiol15, 479-491, doi:10.1038/nrmicro.2017.47 (2017).
8. Fried, M. & Duffy, P. E. Adherence of Plasmodium falciparum to chondroitin sulfate A in the human placenta. Science 272, 1502-1504, doi:10.1126/science.272.5267.1502 (1996).
9. Ghumra, A.et al.Identification of residues in the Cmu4 domain of polymeric IgM essential for interaction withPlasmodium falciparumerythrocyte membrane protein 1 (PfEMP1).J Immunol181, 1988-2000,doi:10.4049/jimmunol.181.3.1988 (2008).
10. Crosnier, C. et al. Binding of Plasmodium falciparum Merozoite Surface Proteins DBLMSP and DBLMSP2 to Human Immunoglobulin M Is Conserved among Broadly Diverged Sequence Variants. J Biol Chem 291, 14285-14299, doi:10.1074/jbc.M116.722074 (2016).
- 陆剑课题组揭示果蝇上游开放读码框的演化规律与补偿机制2026.03.27
- 魏文胜课题组受邀综述:利用碱基与引导编辑器实现疾病相关变异的大规模解码2026.03.23
- 焦雨铃研究组构建禾本科花序发育数学模型,指导小麦高产基因挖掘2026.03.16
- 何爱彬团队与合作者开发新一代表观液体活检平台实现疾病组织器官精准溯源2026.03.05
- 陈雪梅教授课题组揭示新型RNA帽子修饰的跨物种分布与动态调控2026.03.05
- 肖俊宇团队与赵明辉、谭颖团队合作揭示补体系统C3转化酶组装及识别底物C3的分子机制2026.02.21
- 钟声课题组鉴定到拟南芥隔膜处“阻止多花粉管穿出”受体复合物的新组分2026.02.11
- 钟声研究员与瞿礼嘉院士合作揭示被子植物两次受精事件对受精补偿效率的关键作用2026.02.11
- 陈雪梅研究组揭示RdDM通路在作物免疫调控中的新功能,为大豆抗病改良提供了潜在的新思路、新靶点2026.02.10
- 秦跟基课题组揭示调控种子大小的新机制2026.02.10
- 罗述金课题组古DNA研究揭示:日本晚更新世并无虎,而为洞狮2026.01.27
- 张蔚课题组与合作者揭秘蜘蛛纺器起源2026.01.15
- 伊成器研究组报道AIM平台,突破“单点编辑”限制,实现RNA多位点、多功能精准操控2026.01.07
- 田望课题组发现植物抗逆“全能选手”,为提高植物“钙营养”和复合逆境抗性提供新概念2026.01.06
- 张蔚课题组与合作者揭示红珠凤蝶马兜铃酸抗性机制2026.01.05
- 刘君团队开发FOCAS平台实现m6A修饰位点的全转录组功能解析2026.01.05
- 肖俊宇研究组揭示FcRL5受体识别 IgG的分子机制2026.01.02
- 王伟课题组报道应激颗粒实现胞内氧化还原异质性的新功能:细胞抗氧化的“智能调控枢纽”2025.12.22
- 李晟课题组与合作者揭示保护地缓解人类对兽类行为干扰的关键作用2025.12.15
- 姚蒙研究组系统评估无脊椎动物宏条形码引物,助力eDNA生物多样性研究2025.12.12
- 朱丹萌课题组与合作者揭示PICKLE调控染色质状态与基因转录的分子机理2025.12.09
- 季雄团队提出FeaSion策略揭示RNA聚合酶磷酸化的特征调控与功能2025.12.01
- 罗述金课题组古DNA研究揭示:豹猫与人共栖3500年直至汉末,家猫经丝绸之路唐代方始传入2025.11.28
- 白洋研究员入选第三期 “新基石研究员项目”资助名单2025.11.26
- 实验室主任瞿礼嘉教授2025年新当选中国科学院院士2025.11.25
- 汪阳明团队与西湖大学卢培龙团队利用人工智能辅助蛋白质设计实现精准线粒体DNA碱基编辑2025.11.18
- 肖俊宇和高宁团队联合发表多聚抗体设计策略2025.11.07
- 赵进东课题组应邀撰写藻胆体的结构和能量传递机制长文综述2025.10.28
- 郑晓峰课题组揭示代谢酶ALDOA入核激活NF-κB信号通路驱动胰腺癌进展2025.10.23
- 陆剑课题组揭示果蝇饥饿耐受的遗传架构和性别差异2025.09.29
- 遇赫课题组揭示中国家猪的起源传播与人群互动过程2025.09.26
- 季雄团队揭示INO80/SWR复合物通过BRD2和染色质景观调控Pol II转录起始2025.09.22
- 刘启昆课题组与合作者在Current Opinion in Plant Biology发文总结植物再生领域表观遗传调控的研究进展2025.09.18
- 钟上威课题组受邀发表植物光信号传导Tansley长文综述2025.09.16
- 姚蒙课题组研发新型空气eDNA采集器高效检测动植物多样性2025.09.11
- 焦雨铃研究组克隆了小麦粒重新基因,服务高产育种2025.09.02
- 魏文胜团队与合作者联合开发新型通用型CAR-T 疗法治疗血液系统恶性肿瘤2025.08.22
- 魏文胜团队开发RNA环化新方法2025.08.12
- 汪阳明团队创新双组学技术MAPIT-seq:在单细胞水平同时绘制RNA结合蛋白作用图谱与基因表达图谱的新利器2025.08.11
- 周岳课题组揭示拟南芥PRC1介导的H2Aub loop的形成机制及功能2025.08.11
- 贺新强课题组与周岳课题组合作揭示PRC2调控维管组织模式建立机制2025.08.11
- 苏晓东课题组揭示清道夫受体CD163识别底物的分子机制2025.07.23
- 陈雪梅课题组系统阐释植物miRNA成熟与功能调控机制2025.07.23
- 苏晓东课题组与合作者揭示AAV与新型受体(AAVR2)结合的分子机制2025.07.15
- 合成植物基因组2025.07.09
- 伊成器课题组与合作者建立RNA"暗码",升级生命语言2025.07.04
- 魏文胜团队系统揭秘人类基因组中“沉默突变”的功能性“低语”2025.06.26
- 肖俊宇团队与张永辉团队合作揭示嗜乳脂蛋白激活γδ T细胞的“分子钳”机制2025.06.12
- 昌增益课题组揭示蛋白质内源性(顺式)去组装元件调控细菌细胞分裂环(Z环)的动态形成2025.06.09
- 陆剑课题组揭示uORF在动物进化与发育中发挥“翻译减震器”调控作用的新机制2025.06.09
- 张蔚课题组与合作者揭示兰花螳螂程序性体色转变的分子机制及生态学意义2025.05.30
- 2025年“全国科技活动周”和“全国科技工作者日”活动2025.05.29
- 李川昀团队与合作者开发细胞通讯分析工具STCase,揭示肿瘤微环境中空间特异性通讯事件2025.05.29
- 伊成器课题组系统阐释假尿嘧啶修饰的功能与治疗应用新范式2025.05.27
- 瞿礼嘉/钟声团队应邀撰写被子植物雌-雄相互作用保证双受精成功综述2025.05.26
- 陆剑课题组与合作者共同揭示uORFs通过精细调节CLOCK蛋白的翻译参与果蝇昼夜节律及睡眠行为的调控机制2025.05.16
- 伊成器团队发展痕量样品m6A修饰定量测序方法2025.05.08
- 白洋团队联合多位顶尖科学家系统解析根际微生物组调控水稻分蘖的功能与机制2025.04.24
- 瞿礼嘉/钟声课题组发现植物传粉过程中“未雨绸缪”的“两步授粉”备份新机制,为作物逆境下的育性优化提供新思路2025.04.15
- 曾虎课题组应邀撰写综述:空间组学技术的研究进展2025.04.06
- 张迪课题组受邀综述蛋白质L-乳酰化的研究进展2025.04.04
- 苏晓东课题组揭示短序列锚定元件AE在DNA与蛋白质结合中的重要作用2025.03.31
- 魏文胜团队实现人类肿瘤免疫调控网络的单碱基精度解析2025.03.21
- 白洋团队构建全球首个作物根际"细菌+病毒"基因组数据库2025.03.13
- 季雄团队揭示RNA聚合酶亚基RPB7偶联磷酸酶CTDP1稳定Pol II并介导转录再起始2025.03.05
- 何爱彬团队利用全景单细胞组蛋白修饰实现胚胎发育谱系追踪2025.03.04
- 赵进东课题组揭示蓝细菌藻胆体与光系统II结合的新分子机制2025.02.17
- 高歌课题组提出面向大规模异质性空间转录组学切片的表征与解析新方法2025.02.12
- 周岳课题组揭示拟南芥雄性生殖细胞发育过程中染色质三维结构的动态变化过程及其重要作用2025.02.12
- 魏文胜团队发布新一代线粒体碱基编辑器助力建立疾病动物模型2025.01.23
- 贺新强课题组揭示木质部管状分子发育的microRNA调控网络2025.01.19
- 周岳课题组在Genome Biology发文揭示了拟南芥中启动子空间调控模式和喷泉结构形成机制2025.01.02
- 高歌课题组提出人类转录调控元件建模与相关非编码变异功能解析方法2025.01.02
- 魏文胜团队利用碱基编辑器筛选绘制DNA损伤应答功能元件图谱2024.12.16
- 秦跟基课题组揭示弱光下种子萌发调控新机制2024.12.05
- 刘启昆课题组开发了全新的植物细胞谱系追踪工具2024.11.26
- 周岳课题组揭示植物首个三维基因组结构蛋白及其调控机制2024.11.22
- 周岳课题组揭示植物特有的PWWP结构域蛋白调控基因表达的分子机制2024.11.22
- 国家重点实验室陈雪梅教授获得2024年度“求是杰出科学家奖”2024.11.08
- 秦跟基课题组应邀撰写品牌综述“Tansley insight”总结TCP转录因子在细胞器、细胞和器官命运决定中的重要功能2024.10.28
- 郑晓峰课组揭示USP1-ATF4-CD98hc调控ENKTL淋巴瘤患者耐药的新机制2024.09.30
- 肖俊宇课题组揭示IgM–CD5L复合物的分子机制2024.09.30
- 陆剑课题组揭示密码子使用偏好性对翻译调控的影响2024.09.30
- 魏文胜团队实现蛋白质组中丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点的功能解析2024.09.24
- 王继纵/邓兴旺课题组合作解析植物光敏色素phyB光信号转导的机制2024.09.24
- 刘君/杨雪瑞课题组合作揭示m6A-cenRNA调控癌细胞着丝粒稳态的机制2024.09.23
- 伊成器教授荣获2024年“科学探索奖”2024.08.29
- 王伟课题组报道蛋白酶体调控SG稳态抵御高温胁迫的新机制2024.08.22
- 肖俊宇团队阐明IgE 高亲和力受体FcεRI 复合物的组装机制2024.08.22
- 朱玉贤院士团队发布首个棉花基因组完整图谱,阐述棉族独特折叠胚胎形成的分子与演化机制2024.08.16
- 李晴课题组报道了滞后链核小体组装和冈崎片段成熟的协同机制2024.08.13
- 魏文胜团队报道非脱氨酶依赖的嘧啶碱基编辑器TBE2024.08.03
- 李晴研究组与合作者报道真核DNA复制体介导的亲本组蛋白表观遗传信息继承新机制2024.08.02
- 张迪课题组与合作者共同报道区分蛋白质乳酰化修饰同分异构体的新方法2024.07.22
- 国际遗传工程和生物技术中心(ICGEB)总干事Lawrence Banks教授一行访问陆剑课题组2024.06.26
- 郭强课题组与合作者揭示Synaptophysin调控突触小泡生成与功能的机制2024.06.06
- 2024年全国科技周开放活动2024.05.28
- 李磊课题组解析miR408平衡植物生长和抗旱的分子机制2024.05.16
- 李晟课题组与合作者研究揭示华北地区华北豹栖息地及其景观连通性现状2024.05.06
- 陆剑课题组揭示黑腹果蝇演化历史和环境适应机制2024.04.19
