伊成器和合作者报道tRNA-m1A修饰调控CD4+ T细胞功能的新机制

2022年9月22日，上海交通大学医学院李华兵研究员、北京大学蛋白质与植物基因研究国家重点实验室伊成器教授、陆军军医大学吴玉章和耶鲁大学医学院RichardFlavell团队合作在Nature Immunology上发表了题为 tRNA-m¹A modification promotes T cell expansion via efficient MYC protein synthesis 的研究论文，该研究揭示了m¹A修饰催化酶TRMT61A通过催化新合成tRNA第58位腺嘌呤的1-甲基腺嘌呤（m¹A）修饰，加速CD4⁺ T细胞激活后多种关键蛋白的翻译，保证CD4⁺ T细胞的迅速免疫应答。该研究首次详细地阐明了CD4⁺ T细胞功能改变过程中tRNA化学修饰控制细胞内翻译的分子机制。

T细胞在免疫反应中发挥核心作用。当受抗原刺激时，处于静息状态的T细胞快速激活，大量增殖分化。免疫激活是免疫反应中非常重要的一步，之前的研究集中于探究转录调控在T细胞激活过程中的作用^[1]。鉴于T细胞激活在短时间内快速发生，转录调控不能及时满足T细胞大量合成蛋白的需求，因此翻译效率的调控可能也发挥重要作用。

tRNA在翻译过程中发挥着重要作用。除了tRNA丰度之外，tRNA上的化学修饰可以通过稳定tRNA结构，帮助tRNA进行codon识别等途径影响翻译过程。其中，m¹A是tRNA上丰度最高最保守的一种修饰，由TRMT6/TRMT61A复合物进行修饰，tRNA-m1A修饰可以增强翻译起始和延伸^[2]。伊成器课题组在2017年建立了m¹A修饰位点的单碱基分辨率鉴定技术^[3]。

该研究首先观察到T细胞激活过程中蛋白质翻译相关通路上调，不同的tRNA也表现出不同时间点上调的动态表达模式，tRNA-m1A58修饰酶TRMT6/TRMT61A在激活过程中也上调。作者利用Trmt61a条件性敲除小鼠，证明在体内、体外条件下，Trmt61a缺失时T细胞激活免疫功能受损，T细胞增殖能力显著降低。同时，发现Trmt61a缺失导致T细胞中大部分tRNA的m1A58修饰显著减少，导致 T细胞激活后多种关键蛋白的翻译受阻，特别是转录因子MYC。MYC蛋白翻译效率的降低使T细胞激活后的快速克隆扩增受阻。

作者随后探究了Trmt61a调控翻译的特异性。通过对RiboTag-seq, tRNA-seq,tRNA-m¹A-seq的多组学联合分析，研究人员发现翻译效率下调的基因（如Myc）有tRNA codon使用偏好性，更偏好使用在激活早期高表达的tRNA,而这部分tRNA又是Trmt61a缺失高度敏感的tRNA。

该研究第一次将tRNA修饰与T细胞的功能变化连接起来，并系统性地探究了原代T细胞扩增过程中控制翻译的具体机制，表明tRNA的使用及其修饰可以对蛋白表达和细胞功能带来显著改变。这项研究表明TRMT61A介导的tRNA-m¹A58修饰作为CD4⁺ T细胞增殖调控的新型“翻译检查点”，将为改善CD4⁺ T细胞介导的炎症应答及增强肿瘤免疫治疗效果提供新的RNA表观遗传策略。

TRMT61A介导的tRNA-m¹A58修饰是CD4⁺ T细胞激活增殖调控的“翻译检查点”

上海交通大学医学院刘永波博士、周静副研究员和硕士研究生施金彤，北京大学生命科学学院已出站博士后李笑雨（现浙江大学医学院研究员），博士研究生张晓婷为本论文的共同第一作者，上海交通大学医学院李华兵研究员、北京大学生命科学学院伊成器教授、陆军军医大学吴玉章教授及耶鲁大学医学院Richard A.Flavell教授为该文的共同通讯作者。    

原文链接：

https://www.nature.com/articles/s41590-022-01301-3

参考文献：

1.Kaech, S. M. & Cui, W. Transcriptional control of effector and memory CD8+ T cell differentiation. Nat Rev Immunol 12, 749–761 (2012).

2．Liu, F.et al.ALKBH1-Mediated tRNA Demethylation Regulates Translation. Cell167, 816-828.e16 (2016).

3.Li, X.et al.Base-Resolution Mapping Reveals Distinct m1A Methylome in Nuclear- and Mitochondrial-Encoded Transcripts. Mol.Cell 68, 993-1005.e16 (2017).