季雄 研究员
RNA聚合酶研究组
北京大学 生命科学学院 研究员，博士生导师
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研究兴趣包括RNA聚合酶和分子计算相关的基因表达调控机理。以早期胚胎干细胞和癌症细胞为模型，运用计算理论、基因组学、蛋白质组学、生物信息学、计算机模拟、CRISPR基因编辑、光学成像和生物化学等多学科技术开展基因表达调控中的生命分子计算原理研究。主要致力于：
1. RNA聚合酶相关的分子机理、疾病与探针
2. 生命分子计算模型与设计
本实验室长期致力于基因表达调控研究，近年研究进展包括：1）系统解析RNA聚合酶II（Pol II）各亚基功能分工，发现游离RPB3亚基特异性调控核糖体蛋白基因3'末端加工的非经典功能机制；2）建立高效三维染色质结构检测方法，证明RNA聚合酶I、II和III参与建立和维持局部染色质高级结构，并阐明Pol III通过调控局部染色质结构协调邻近Pol II转录速率的新机制；3）鉴定调控Pol II介导基因表达的新因子和新机制，包括：组蛋白β-羟基丁酰化修饰、分子伴侣RUVBL1/2、组蛋白乙酰化识别因子BRD2、转录因子ZBTB21等。近5年在Cell (2023), Molecular Cell (2022, 2023), Nature Communications (2022，2025), Nucleic Acids Research (2023，2024)，Genome Biology (2020, 2022), Cell Discovery (2020), Cell Reports (2023)等国际著名期刊发表20余篇高影响力学术论文。
Li Y, Huang J, Bao L, Zhu J, Duan W, Zheng H, Wang H, Jiang Y, Zhang M, Yi CQ, Ji X. (2023) Pol II preferentially regulates ribosomal protein expression by trapping disassociated subunits. Mol. Cell, 83: 1280-1297.
Qin F, Li B, Wang H, Ma S, Li J, Liu S, Kong L, Zheng H, Zhu R, Han Y, Yang M, Li K, Ji X, Chen P. (2023) Linking chromatin acylation mark-defined proteome and genome in living cells. Cell, 186: 1066.
Wang H, Li B, Zuo L, Wang B, Yan Y, Tian K, Zhou R, Wang C, Chen X, Jiang Y, Zheng H, Qin F, Zhang B, Yu Y, Liu C, Xu Y, Gao J, Qi Z, Deng W, Ji X. (2022) The transcriptional coactivator RUVBL2 regulates Pol II clustering with diverse transcription factors. Nat. Commun., 13: 5703.
Li Y, Huang. J, Zhu J, Bao L, Wang H, Jiang Y, Tian K, Wang R, Zheng H, Duan W, Lai W, Yi X, Zhu Y, Guo T, Ji X. (2022) Targeted protein degradation reveals Pol II heterogeneity and functional diversity. Mol. Cell, 82: 3943-3959.
Jiang Y, Huang J, Lun K, Li B, Li Y, Zheng H, Li Y, Zhou R, Duan W, Wang C, Feng Y, Yao H, Li C, Ji X. (2020) Genome-wide Analyses of Chromatin Interactions After the Loss of Pol I, Pol II and Pol III. Genome Biology. 21: 158.
王蕊、金杰、阿曼妮萨·图尔荪托合提、郑浩楠、包丽君、朱峻毅、史庭昕、刘美彤、皇杰霖、季德洵、隋远涵、徐圣淳、朱闻起
