2007年4月13日，蛋白质工程及植物基因工程国家重点实验室在新生命科学大楼邓佑才报告厅召开了2006年重点实验室学术委员会暨实验室全体会议。国家重点实验室学术委员会主任、北京大学校长许智宏院士，国家自然科学基金委朱作言院士、医科院强伯勤院士、军科院沈倍奋院士、中科院微生物学研究所方荣祥院士、中科院上海生化细胞所王恩多院士、中科院生物物理研究所王志珍院士、中科院遗传与发育研究所所长薛勇彪教授、中国农业大学巩志忠教授、北京生命科学研究所柴继杰研究员及室内学术委员赵进东、朱玉贤、苏晓东等13人出席了本次会议，重点实验室全体教师和同学们约200人出席了会议。会议由重点实验室学术委员会副主任赵进东主持，实验室主任朱玉贤教授做了实验室2006年工作总结报告，植物与病原相互作用研究组李毅教授、微生物基因调控及功能基因研究组王忆平教授、蛋白质组学研究组纪建国教授、疾病功能基因研究组组长顾军教授先后在会上做了课题进展报告。

报告会后进行了重点实验室2006年度开放课题评审以及讨论2006-2007年研究方向、课题设置及实验室的调整与改革等。各位学术委员在发言中充分肯定了实验室最近一年来发生的重大变化和进步，认为实验室2006年发表SCI文章的质量和影响因子有明显提高。委员们认为由于国家重点实验室的学者能够长期执著、低调、务实地从事科学研究，形成了较明显的系统性、可持续性并积累了大量经验，实验室已顺利完成新老接替任务。委员们强调蛋白质工程及植物基因工程国家重点实验室要以蛋白质和植物基因研究为核心开展工作并形成特色和亮点。委员们认为，研究成果的评定不能只看影响因子，还要从学科发展的可持续性来评价，要加强学科间大跨度的国际合作以及实验室与医学院校和分子医学研究所的合作，不断增加和保持优秀人才的引进和博士生的派出，做好人才培养工作。最后，学委会主任许智宏院士做了总结发言，再次肯定了重点实验室一年来的进步，并希望以后能凝炼出多个系统性的科学问题，进一步加强跨学科合作与交流，充分利用教育部的新政策，多派博士生到国外知名大学进行合作研究，为我国的科学教育事业作出新贡献。